28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2349 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2349  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 943 aa  1899    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  37.33 
 
 		 505 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.59 
 
 		 386 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 379 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  36.36 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  35.9 
 
 		 501 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 		 423 aa  49.3  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  36.36 
 
 		 485 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.26 
 
 		 674 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.42 
 
 		 324 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  37.14 
 
 		 386 aa  48.9  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 		 471 aa  48.5  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  31.75 
 
 		 443 aa  48.5  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  42.03 
 
 		 477 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.79 
 
 		 360 aa  47.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 434 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.63 
 
 		 310 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.71 
 
 		 577 aa  47  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  36.07 
 
 		 383 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 396 aa  46.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  32.56 
 
 		 487 aa  46.2  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 444 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.68 
 
 		 569 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  33.33 
 
 		 504 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  28.3 
 
 		 540 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.36 
 
 		 537 aa  45.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.41 
 
 		 450 aa  44.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  32 
 
 		 394 aa  44.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>