137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2708 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  43.1 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  44.83 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  43.97 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  42.92 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  44.58 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  42 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  37.13 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  36.58 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  36.36 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  36.19 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  34.31 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  34.26 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  34.43 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  34.06 
 
 		 407 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  31.8 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  38.79 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  37.25 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  34.27 
 
 		 519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  36.48 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  30.71 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  34.2 
 
 		 655 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  36.48 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  36.05 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  36.48 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  36.48 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  30.59 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  29.53 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  32.02 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  33.04 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  30.23 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  34.36 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  29.12 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  31.03 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  29.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  32.78 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  30.13 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.6 
 
 		 512 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  30.86 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  32.62 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  32.52 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  31.22 
 
 		 824 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  30.74 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  30.67 
 
 		 602 aa  89.4  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  31.5 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  29.31 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  27.45 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  29.3 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  31.77 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  30.67 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  30.81 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  28.72 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  33.53 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  29.91 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  33.85 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  31.03 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  29.02 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  31.82 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  31.25 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  29.2 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  30.9 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  30.94 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  29.6 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  26.78 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  30.29 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  29.38 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  32.5 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  30.89 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  26.59 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  26.59 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  28.27 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  29.9 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  29.9 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  28.52 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  28.21 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  28.16 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  31.28 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  28.51 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  30.77 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  27.66 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  26.69 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  29.13 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  26.09 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  32.31 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  28.86 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1836  precorrin-6A reductase  23.01 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  27.05 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  29.33 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05611  precorrin-6X reductase  23.43 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0320494  normal  0.393201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  29.2 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  25.74 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  27.47 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  28.88 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  28.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  25.89 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  28 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  27.75 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  27.6 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  28 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>