133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0378 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  75 
 
 
244 aa  332  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  70.83 
 
 
239 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  64.44 
 
 
243 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  60.26 
 
 
250 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  56.61 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  49.17 
 
 
244 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  51.67 
 
 
253 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  53.33 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  50.2 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  53.06 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  49.39 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  52.65 
 
 
242 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  52.65 
 
 
242 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  51.67 
 
 
244 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  46.5 
 
 
273 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  40.41 
 
 
252 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  43.62 
 
 
246 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  40.98 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  46.72 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  52.7 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  46.96 
 
 
250 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  48.4 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  45.24 
 
 
266 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  46.31 
 
 
271 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  46.09 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  44.9 
 
 
245 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  43.44 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  42.8 
 
 
265 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  41.22 
 
 
257 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  42.28 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  43.72 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  41.56 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 
249 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  39.59 
 
 
251 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  39.09 
 
 
248 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  39.09 
 
 
248 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  41.52 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  44.03 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  44.44 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  43.9 
 
 
268 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  38.74 
 
 
255 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  40.62 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  42.6 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  38.7 
 
 
253 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  39.91 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  39.91 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  40.81 
 
 
239 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  40.57 
 
 
253 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  39.73 
 
 
242 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  39.46 
 
 
247 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  44.39 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  37.95 
 
 
239 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  32.79 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  41.51 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  39.47 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  43.09 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 
242 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  38.74 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  38.74 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  37.5 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  40.76 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  41.11 
 
 
287 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  39.44 
 
 
230 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  38.57 
 
 
239 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  39.64 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  34.98 
 
 
246 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  37.67 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  38.91 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  33.63 
 
 
246 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  39.64 
 
 
243 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  36.97 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  39.33 
 
 
253 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  37.96 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  30.8 
 
 
261 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  38.74 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  33.05 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  29.61 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  29.8 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  26.94 
 
 
407 aa  82  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  33.53 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  39.91 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  39.64 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  22.69 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  29.96 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  25 
 
 
655 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  37.56 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  39.46 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.47 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  30.8 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  30.8 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  34.85 
 
 
519 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>