131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0705 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  45.31 
 
 
249 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  35.68 
 
 
259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  35.32 
 
 
258 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  31.91 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  34.26 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  32.9 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  36.48 
 
 
252 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  28.4 
 
 
519 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  28.68 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  28.51 
 
 
255 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  34.41 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  34.52 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  32.76 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  34.51 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  33.47 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  30.52 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  35.71 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  27.39 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  26.96 
 
 
263 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  26.96 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  30.53 
 
 
261 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  30 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  26.96 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  26.96 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  30 
 
 
258 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  36.68 
 
 
254 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  29.88 
 
 
250 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  28.4 
 
 
263 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.9 
 
 
512 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  27.47 
 
 
269 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  27.59 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  25.1 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  28.27 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.26 
 
 
407 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  27.83 
 
 
655 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.68 
 
 
602 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  24.78 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  25.85 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  26.43 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  26.96 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  22.71 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  25.55 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  22.36 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  27.49 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  25.11 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  29.3 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  25.44 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  27.84 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  24.6 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  24.48 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  20.99 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  22.62 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  22.62 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  22.48 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  21.05 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  22.41 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  25.1 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  22.08 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  24.67 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  26.11 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  24.02 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  21.93 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  22.22 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  24.45 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  24.23 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  23.04 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  21.01 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  22.03 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  18.97 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  21.49 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  22.37 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  21.34 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  20.61 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  21.49 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  23.41 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  23.12 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  21.68 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  22.62 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  21.49 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  24.58 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  22.17 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  20.2 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  20.51 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  23.98 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  24.34 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  22.6 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  20.09 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  19.57 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  29.83 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  21.83 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  21.49 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  23.91 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  20.28 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  21.3 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  21.3 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  23.38 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  19.19 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  21.7 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  21.7 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>