136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4722 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  100 
 
 		 273 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  93.77 
 
 		 273 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  80.83 
 
 		 271 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  64.14 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  63.82 
 
 		 253 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  62.96 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  62.6 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  56.2 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  52.67 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  50.84 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  52.7 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  50.42 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  51.52 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  50.21 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  49.79 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  49.79 
 
 		 247 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  52.04 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  44.31 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  52.23 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  46.56 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  48.13 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  43.75 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  42.17 
 
 		 249 aa  195  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  42.92 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  44.53 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  47.25 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  56.5 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  51.8 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  46.49 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  45.71 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  48.56 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  44.03 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  44.16 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  42.8 
 
 		 239 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  45.71 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  44.14 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  44.14 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  41.85 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  41.2 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  44.87 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  46.85 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  45.26 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  46.19 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  45.42 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  43.64 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  45.42 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  41.74 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  41.49 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  43.3 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  44.58 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  42.98 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  44.17 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  42.92 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  45.87 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  46.59 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  46.5 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  45.71 
 
 		 244 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  42.54 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  45.13 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  43.48 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  45.66 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  45.9 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  44.77 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  44.77 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  44.1 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  45.37 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  45.71 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  44.69 
 
 		 242 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  44.4 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  44.26 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  44.31 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  41.04 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  47.37 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  47.81 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  45.19 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  36.32 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  47.06 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  44.98 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  44.93 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  43.33 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  34.36 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  32.82 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  29.41 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  25.36 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  22.36 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  28.91 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  26.29 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  32.68 
 
 		 519 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  27.63 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  29.74 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  28.36 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  30.04 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  29.61 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>