127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2537 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  63.95 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  63.52 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  62.23 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  57.21 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  55.6 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  55.22 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  53.19 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  55.91 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  55.66 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  51.77 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  52.1 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  48.03 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  44.5 
 
 		 246 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  48.17 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  46.57 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  49.75 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  49.05 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  44.09 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  45.04 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  43.64 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  45.21 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  38.74 
 
 		 249 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  44.67 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  45.12 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  43.11 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  43.11 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  46.19 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  41.47 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  46.19 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  43.72 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  43.18 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  47.42 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  45.58 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  43.48 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  41.74 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  47.85 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  46.23 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  42.22 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  45.81 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  40.43 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  44.22 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  42.57 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  42.29 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  44 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  38.76 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  41.5 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  40.87 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  43.78 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  39.52 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  39.9 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  41.58 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  42.18 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  42.18 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  40.49 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  39.72 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  34.26 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  39.52 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  40.2 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  37.56 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  46.73 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  40.8 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  43.37 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  39.52 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  35.15 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  36.91 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  36.91 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  37.71 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  43.66 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  42.65 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  43.28 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  38.91 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  41.92 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  41.62 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  42.65 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  34.4 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  43.22 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  42.18 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  42.18 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  38.42 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  33.53 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  32.6 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  28.5 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  32.14 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  30.85 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  32.99 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  27.05 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  27.22 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  24.26 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  29.28 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  32.02 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  24.77 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  27.9 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>