136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3181 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  78.31 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  77.91 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  72.97 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  58.17 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  59.26 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  59.26 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  55.42 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  58.85 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  55.43 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  58.18 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  52.26 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  52.17 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  54.55 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  50.42 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  56.59 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  50.21 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  50.21 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  52.7 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  51.58 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  51.65 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  55.66 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  54.19 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  50.62 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  43.98 
 
 		 249 aa  205  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  49.79 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  48.36 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  48.23 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  40.98 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  45.08 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  47.54 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  45.08 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  46.29 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  47.28 
 
 		 248 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  51.24 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  49.81 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  48.55 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  46.29 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  47.52 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  48.98 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  44.26 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  42.32 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  46.06 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  43.15 
 
 		 244 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  44.84 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  47.33 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  44.98 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  47.6 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  45.61 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  45.61 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  42.54 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.74 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  45.34 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  40.5 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  40.5 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  35.92 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  43.61 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  46.49 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  36.84 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  43.61 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  42.92 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  42.2 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  40.27 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  44.74 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  38.94 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  39.85 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  45.61 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  41.86 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  42.48 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  46.72 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  41.12 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  44.98 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  40.57 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  44.1 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  34.35 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  44.6 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  34.31 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  25.66 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  29.37 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  32.5 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  28.99 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  29.15 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  27.54 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  27.54 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  28.74 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  29.94 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  31.84 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  31.22 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  24.21 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>