138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3647 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  48.21 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  38.79 
 
 
253 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  33.72 
 
 
258 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  34.76 
 
 
256 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  34.23 
 
 
261 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  34.63 
 
 
249 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  32 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  37.97 
 
 
255 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  33.2 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  32.39 
 
 
254 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  32.76 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  35.17 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  30.6 
 
 
250 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  29.41 
 
 
407 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  31.09 
 
 
655 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  35.22 
 
 
258 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  35.22 
 
 
258 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  31.05 
 
 
261 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  32.33 
 
 
252 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  34.2 
 
 
263 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  32.91 
 
 
519 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  29.29 
 
 
248 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  32.34 
 
 
252 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  28.81 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.92 
 
 
512 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  28.07 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  29.66 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  32.91 
 
 
602 aa  95.9  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  34.89 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  32.28 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  30.2 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
249 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  30.25 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  30.67 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  30.25 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  30.25 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  30.33 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  29.41 
 
 
263 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  32.79 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  30.35 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  26.14 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  27.24 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  33.74 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  26.5 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  32.42 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  32.94 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  28.91 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  26.07 
 
 
254 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  27.49 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  30.71 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  31.28 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  31.51 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  28.57 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  29.28 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  32.16 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  31.49 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  30.2 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  30.2 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  32.64 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  31.75 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  28.03 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  31.09 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  29.44 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  30.93 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  29.64 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  31.65 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  29.25 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  29.25 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  30.54 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  27.51 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  32.64 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  30.33 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  32.06 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  30 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  29.02 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  29.95 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  28.57 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  28.22 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  32.67 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  31.1 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  28.34 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  29.65 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  31.85 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  28.15 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  32.78 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  29.76 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  27.6 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  27.39 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  28.75 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  26.34 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  29.69 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  30.17 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  30.98 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>