83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1233 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  96.85 
 
 
254 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  34.75 
 
 
256 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  38.43 
 
 
250 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  37.45 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  31.8 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  32.48 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  32.27 
 
 
252 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  30.08 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  29.58 
 
 
261 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  30.17 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  30.36 
 
 
655 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  29.3 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  28.89 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  28.89 
 
 
263 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 
263 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 
263 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  33.61 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  28.63 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.74 
 
 
407 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  28.29 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  31.2 
 
 
247 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  32.39 
 
 
249 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  32.08 
 
 
245 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  32.13 
 
 
254 aa  105  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  29.76 
 
 
248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 
258 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  25.88 
 
 
258 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  28.51 
 
 
519 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  30.16 
 
 
248 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  24.3 
 
 
254 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  27.39 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.5 
 
 
512 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  29.27 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  27.63 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  26.5 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  29.3 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  28.69 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  27.03 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05671  precorrin-6X reductase  26.17 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.252716  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  25 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  25.62 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.42 
 
 
824 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  24.42 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  22.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  24.08 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  24.02 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  25.15 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  24.02 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  22.55 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  24.38 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.79 
 
 
602 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  17.33 
 
 
249 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  20 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  22.22 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  16.75 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  24.75 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  24.72 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  22.28 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  23.46 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  20.5 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  18.09 
 
 
242 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  20 
 
 
247 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  23.86 
 
 
262 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  21.11 
 
 
273 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  24.88 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  16.83 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  18.25 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  20.25 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  21.88 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  17.31 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  21.18 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  21.5 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05611  precorrin-6X reductase  23.27 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0320494  normal  0.393201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  18.97 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  20 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  22.28 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1836  precorrin-6A reductase  22.86 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  24.51 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  22.53 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  18.59 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  19.83 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>