105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4478 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  40.4 
 
 		 602 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  39.92 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  31.06 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  31.65 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  31.09 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  28.14 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  29.22 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  30.74 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  31.2 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  25.29 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  28.75 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  30.17 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  26.96 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  28.69 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  27.35 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  27.12 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  24 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  26.14 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  27.66 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  25.64 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  28.14 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  26.74 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  25.21 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  28.69 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  28.69 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  25.52 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  27.47 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  27.39 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  27.39 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  24.78 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  24.02 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  25.58 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  25 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  24.31 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  23.08 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  22.88 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  26.7 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  25.32 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  21.55 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  24.42 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  21.55 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  21.55 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  24.58 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  21.55 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  22.84 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  23.35 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  24.35 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  23.26 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  26.5 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  27.89 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  22.89 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  24.58 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  25 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  22.53 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  23.72 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  23.92 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  27.05 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  26.12 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  27.43 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  26.34 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  23.59 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  25.1 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  25.53 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  25.53 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  22.9 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  25.89 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  24.28 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  22.82 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  24.03 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  24.12 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  24.1 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  25.43 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  21.35 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  23.73 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  22.48 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  22.48 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  21.21 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05671  precorrin-6X reductase  22.27 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.252716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  24.49 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  23.18 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  25.62 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  26.55 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  25.53 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  24.6 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  24.28 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  23.08 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  24.47 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  26.29 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  21.76 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  25.32 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  25.32 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  23.23 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  25.32 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  21.52 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25 
 
 		 824 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  25.32 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  26.46 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>