125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1007 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  90.65 
 
 		 247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  86.29 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  67.89 
 
 		 249 aa  355  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  52.76 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  34.26 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  32.8 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  29.53 
 
 		 519 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  32.49 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  31.76 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  34.94 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  34.52 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  29.12 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  33.2 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  30.32 
 
 		 655 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  30.89 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  29.76 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  27.49 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  30.38 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  27.49 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  29.76 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.16 
 
 		 512 aa  99.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  27.9 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  25.29 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  25.96 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  27.65 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  26.92 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  28.5 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  29.29 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  30.88 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  25.97 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  25.97 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  25 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  26.92 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  29.21 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  25.97 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  25.54 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  26.02 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  27.35 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  25.1 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  25.64 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  24.64 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  24.14 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  24.04 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  27.62 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  21.51 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  25.11 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  24.02 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  23.29 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  26.15 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  22.03 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  25.71 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  24.49 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  24.5 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  21.92 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  19.76 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  27.2 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  22.54 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  27.27 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  21.54 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  23.11 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  23.11 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05671  precorrin-6X reductase  26.92 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.252716  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  26.72 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  22.45 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  23.22 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  24.75 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  26.81 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  21.97 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  24.54 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  22.12 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  21.74 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  23.38 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  22.62 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  22.4 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  22.22 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  23.15 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05611  precorrin-6X reductase  24.49 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0320494  normal  0.393201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  22.17 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  21.69 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1836  precorrin-6A reductase  24.49 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  23.56 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  27.27 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  25.34 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  23.35 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  21.7 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  20.7 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  20.7 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  21.03 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  24 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  23.62 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  23.11 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  23.02 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  24 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>