82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1427 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  96.85 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  39.22 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  35 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  32.05 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  35.16 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  30.59 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  31.47 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  28.69 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  28.91 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  29 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  28.35 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  30.29 
 
 		 655 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  28.26 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  28.52 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  34.03 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.74 
 
 		 407 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  30.8 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  27.52 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  29.54 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  31.17 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  31.11 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  29.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  29.7 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  28.88 
 
 		 519 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  24.71 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  23.9 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  24.31 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  29.27 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  27 
 
 		 512 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  26.52 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  27.24 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  26.07 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  27.84 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  28.69 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  27.41 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  24.61 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05671  precorrin-6X reductase  26.17 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.252716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.42 
 
 		 824 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  23.14 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  24.03 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  22.97 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  25.15 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  25.21 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.79 
 
 		 602 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  24.08 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  23.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  23.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  22.86 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  18.32 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  20.62 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  22.58 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  24.16 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05611  precorrin-6X reductase  23.77 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0320494  normal  0.393201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  17.16 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  22.04 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  22.39 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  21 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  24.75 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  21.88 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  20.6 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  17.79 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  21.67 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1836  precorrin-6A reductase  23.36 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  18.83 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  21.94 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  21.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  24.39 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  17.56 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  17.82 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  23.71 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  18.09 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  18.83 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  21.98 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  17.73 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  19.16 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  18.64 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  19.61 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>