92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0504 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  83.91 
 
 
263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05601  precorrin-6X reductase  82.38 
 
 
265 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05671  precorrin-6X reductase  67.05 
 
 
264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.252716  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1836  precorrin-6A reductase  37.13 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05611  precorrin-6X reductase  37.07 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0320494  normal  0.393201 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  34.27 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  32.73 
 
 
264 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  32.76 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  28.39 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  28.39 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05041  hypothetical protein  41.35 
 
 
125 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00239155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  27.7 
 
 
254 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  23.33 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  24.81 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.2 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  23.85 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  22.99 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  29.68 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  27.98 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  27.03 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05031  hypothetical protein  31.58 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00611684  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  27.41 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  31.84 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  26 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  24.44 
 
 
519 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  26.78 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  26.67 
 
 
655 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  26.39 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  24.62 
 
 
602 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  23.95 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  26.74 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  27.4 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  27.2 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  26.04 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  26.04 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  20.68 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  26.04 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  28.4 
 
 
407 aa  58.9  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  26.04 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  23.46 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  23.46 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  27.24 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  26.56 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  22.5 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  31.31 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  28.67 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  24.85 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  27.74 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  21 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  27.52 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  30.63 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  26.15 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  26.06 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  21.43 
 
 
253 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  25.58 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  24.12 
 
 
249 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  22.99 
 
 
229 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  24.69 
 
 
260 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  20.68 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  23.59 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  24.23 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  22.41 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  23.47 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  32.38 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  28.67 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  26.79 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  27.68 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25 
 
 
824 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  24.77 
 
 
247 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  24.53 
 
 
246 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  22.94 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  24.77 
 
 
247 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  31.48 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  26.61 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  38.64 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  27.73 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  21.01 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  23.96 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  26.61 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  23.45 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  28.71 
 
 
249 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  20.2 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  24.77 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  21.07 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  35.85 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  29.13 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  22.43 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  32.32 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  21.1 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  28.16 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  20.25 
 
 
245 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>