36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2675 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  56.78 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  64.04 
 
 
239 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  49.72 
 
 
236 aa  175  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  49.73 
 
 
233 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  45.23 
 
 
230 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  48.63 
 
 
233 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  48.9 
 
 
207 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  48.09 
 
 
233 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  48.09 
 
 
233 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  48.09 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  48.09 
 
 
202 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  48.09 
 
 
233 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  47.54 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  48.09 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  43.24 
 
 
258 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  46.89 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  39.39 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1030  hypothetical protein  40.33 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.129268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  38.04 
 
 
572 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0986  hypothetical protein  34.41 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  35.15 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  33.5 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1693  hypothetical protein  28.9 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0471407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1505  hypothetical protein  31.07 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  26.77 
 
 
278 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0756  hypothetical protein  29.28 
 
 
174 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  31.12 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  35.29 
 
 
960 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0758  hypothetical protein  30.07 
 
 
144 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.134868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  35.04 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  31.01 
 
 
966 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  25.96 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  27.64 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  31.4 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  31.39 
 
 
333 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>