17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3112 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  65.98 
 
 
261 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  56.38 
 
 
278 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  56.2 
 
 
298 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  51.82 
 
 
273 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  49.33 
 
 
333 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  47.62 
 
 
283 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  48.73 
 
 
966 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  39.52 
 
 
269 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  51.11 
 
 
960 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  38.15 
 
 
328 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  26.02 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  25.12 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  28.16 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  25.96 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>