28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3429 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  100 
 
 		 273 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  62.96 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  51.89 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  55.65 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  55.6 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  51.82 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  47.92 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  50.25 
 
 		 966 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  52.97 
 
 		 960 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  40.38 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  38.71 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  32.16 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  27.94 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  25.46 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  27.59 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  27.59 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  26.82 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  34.29 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  27.03 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  27.81 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  30.56 
 
 		 572 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>