27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0942 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  100 
 
 
333 aa  634    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  49.19 
 
 
298 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  52.59 
 
 
261 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  45.65 
 
 
278 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  46.13 
 
 
274 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  48.31 
 
 
273 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  44.74 
 
 
283 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  43.63 
 
 
328 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  39.53 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  45.05 
 
 
966 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  45.03 
 
 
960 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  28.35 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  27.23 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  30.66 
 
 
239 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  27.51 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  31.48 
 
 
241 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  23.46 
 
 
202 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  23.46 
 
 
202 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  25.31 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  23.46 
 
 
202 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  23.6 
 
 
207 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  23.46 
 
 
231 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>