30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  535  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  58.13 
 
 
261 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  56.38 
 
 
274 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  61.09 
 
 
298 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  51.89 
 
 
273 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  54.03 
 
 
283 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  46.9 
 
 
333 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  45.69 
 
 
966 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  39 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  40.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  47.57 
 
 
960 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  26.94 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  28.22 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  29.8 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  29.8 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  30.46 
 
 
202 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  31.13 
 
 
207 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  29.3 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  25.95 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  28.76 
 
 
230 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  37.11 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  27.15 
 
 
231 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  27.12 
 
 
572 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>