30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1030  hypothetical protein  69.27 
 
 
235 aa  265  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.129268 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0986  hypothetical protein  45.42 
 
 
253 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  43.1 
 
 
239 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  37.61 
 
 
233 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  37.61 
 
 
233 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  36.73 
 
 
233 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  37.17 
 
 
233 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  37.17 
 
 
233 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  37.17 
 
 
233 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  40.82 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  41.97 
 
 
230 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  40.51 
 
 
202 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  41.44 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  39.18 
 
 
202 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  39.69 
 
 
202 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  41.94 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  39.2 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  32.74 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  39.74 
 
 
572 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  37.74 
 
 
278 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0756  hypothetical protein  30.86 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  32.85 
 
 
966 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  35.09 
 
 
960 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0758  hypothetical protein  24.05 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.134868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1693  hypothetical protein  26.22 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0471407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  36.7 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1505  hypothetical protein  36.76 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  34.68 
 
 
274 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>