23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0986 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0986  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  45.42 
 
 
229 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1030  hypothetical protein  46.19 
 
 
235 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.129268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  42.47 
 
 
230 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  31.08 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  36.17 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  32.13 
 
 
233 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  32.53 
 
 
233 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  31.73 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  31.73 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  31.73 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  34.12 
 
 
202 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  30.95 
 
 
233 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  34.91 
 
 
202 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  33.18 
 
 
202 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  34.86 
 
 
239 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  34.48 
 
 
207 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  34 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  35.48 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  30.35 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  33.14 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  34.65 
 
 
966 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  38.96 
 
 
960 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>