34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1047 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  45.5 
 
 
244 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  42.78 
 
 
239 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  45.23 
 
 
241 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  41.76 
 
 
236 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  41.94 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  41.94 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  41.94 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  41.94 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  41.94 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  41.94 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  41.4 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  40.86 
 
 
202 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  42.7 
 
 
207 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  36.87 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  40.86 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  41.97 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  39.56 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  41.1 
 
 
572 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0986  hypothetical protein  41.4 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1030  hypothetical protein  38.12 
 
 
235 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.129268 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1693  hypothetical protein  26.63 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0471407  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  29.06 
 
 
960 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  28.92 
 
 
278 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  29.06 
 
 
966 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0756  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  29.79 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1505  hypothetical protein  28.05 
 
 
173 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  28.34 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0758  hypothetical protein  30.92 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.134868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  28.16 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  31.89 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  30.14 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  30.48 
 
 
333 aa  42  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>