24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1505 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1505  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  338  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1693  hypothetical protein  55.83 
 
 
177 aa  187  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0471407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  35.03 
 
 
572 aa  77.4  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0756  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0758  hypothetical protein  35.46 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.134868  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  32.28 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  33.58 
 
 
207 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  33.09 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  33.09 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  33.09 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  33.09 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  33.09 
 
 
233 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  32.19 
 
 
241 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  31.39 
 
 
233 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  30.66 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  31.39 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  30.08 
 
 
231 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  27.88 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  26.74 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  26.19 
 
 
258 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1030  hypothetical protein  28.19 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.129268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  35.85 
 
 
229 aa  41.6  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>