22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1693 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1693  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  353  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0471407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1505  hypothetical protein  55.83 
 
 
173 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0756  hypothetical protein  30.86 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  26.63 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  32.45 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  29.84 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0758  hypothetical protein  30.57 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.134868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  29.17 
 
 
241 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  28.48 
 
 
572 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  29.03 
 
 
202 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  28.23 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  27.42 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  27.42 
 
 
202 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  27.75 
 
 
244 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  26.29 
 
 
239 aa  51.6  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2113  hypothetical protein  27.42 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04660  hypothetical protein  25.71 
 
 
229 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>