28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2290 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  66 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  59.22 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  60.67 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  56.59 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0942  integral membrane protein  52.44 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.557386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  47.66 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  47.21 
 
 		 966 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2902  hypothetical protein  41.8 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2434  integral membrane protein  42.21 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  49.44 
 
 		 960 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1968  hypothetical protein  29.69 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000157147  hitchhiker  0.000000864834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1455  hypothetical protein  27.98 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.663778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1241  hypothetical protein  30.83 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0564  hypothetical protein  32.28 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2675  hypothetical protein  29.19 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  33.72 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1915  hypothetical protein  33.72 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1047  hypothetical protein  26.9 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  33.72 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  33.72 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  28.41 
 
 		 572 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3104  hypothetical protein  33.72 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.329323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>