256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0328 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0328  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  38.02 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  38.02 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  34.92 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.05 
 
 
306 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  34.02 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  36.3 
 
 
341 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.37 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.37 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.37 
 
 
303 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  31.54 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
310 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.67 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.67 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.67 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  30 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  30 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  36.54 
 
 
294 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.63 
 
 
311 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  32.99 
 
 
325 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  34.29 
 
 
296 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.37 
 
 
303 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.45 
 
 
309 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.58 
 
 
309 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  30.22 
 
 
310 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  35.35 
 
 
309 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.81 
 
 
309 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
292 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  38.55 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  31.68 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  41.18 
 
 
293 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 
300 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.03 
 
 
309 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.09 
 
 
306 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  32.89 
 
 
304 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 
305 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 
305 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  41.33 
 
 
298 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  31.9 
 
 
310 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  32.43 
 
 
311 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.41 
 
 
345 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
301 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  32.14 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  29.63 
 
 
307 aa  53.9  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.43 
 
 
311 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4319  hypothetical protein  28.95 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  35.04 
 
 
303 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  31 
 
 
309 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.66 
 
 
313 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 
298 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  27.21 
 
 
324 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  34.04 
 
 
311 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.53 
 
 
298 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  35.29 
 
 
308 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  29.63 
 
 
312 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  28.85 
 
 
532 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  29.53 
 
 
341 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 
317 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.66 
 
 
328 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
303 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.55 
 
 
299 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
283 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.82 
 
 
310 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.32 
 
 
289 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  33.8 
 
 
297 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  28 
 
 
303 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  28 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  31.69 
 
 
312 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.76 
 
 
325 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  30.37 
 
 
310 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.19 
 
 
296 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  29.5 
 
 
300 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  28 
 
 
303 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
330 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
300 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.08 
 
 
299 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.07 
 
 
294 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.91 
 
 
324 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
301 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>