141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3059 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0671  formate--tetrahydrofolate ligase  59.49 
 
 		 597 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0705  formate--tetrahydrofolate ligase  59.49 
 
 		 597 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2687  formate--tetrahydrofolate ligase  81.94 
 
 		 587 aa  1011    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162948  hitchhiker  0.00130588 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_609  formate--tetrahydrofolate ligase  59.32 
 
 		 597 aa  724    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0932168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0640  formate--tetrahydrofolate ligase  57.95 
 
 		 605 aa  702    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1296  formate--tetrahydrofolate ligase  56.18 
 
 		 591 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3059  formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 		 587 aa  1212    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000769965  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  45.51 
 
 		 1021 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.48 
 
 		 567 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  45.52 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  44 
 
 		 567 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  43.22 
 
 		 566 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  44.58 
 
 		 564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  45.16 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.58 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  41.09 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  43.79 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  41.61 
 
 		 666 aa  432  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  43.15 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  42.59 
 
 		 564 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  42.98 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  43.45 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  43.61 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  41.45 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  42.34 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  40.79 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  39.59 
 
 		 946 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0561  formate--tetrahydrofolate ligase  41.58 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  40.66 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  41.4 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3314  formate--tetrahydrofolate ligase  41.03 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000257814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3804  formate--tetrahydrofolate ligase  41.09 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.038767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  41.9 
 
 		 556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3748  formate--tetrahydrofolate ligase  41.61 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0520  formate--tetrahydrofolate ligase  40.92 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3930  formate--tetrahydrofolate ligase  41.26 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  41.9 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3469  formate--tetrahydrofolate ligase  41.22 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  41.22 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  40.41 
 
 		 553 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  40.62 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0612  formate--tetrahydrofolate ligase  39.93 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  40.82 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  40.03 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  42.63 
 
 		 572 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  38.86 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  40.96 
 
 		 558 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  39.97 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  41.25 
 
 		 582 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  41.13 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  40 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  40.07 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  41.48 
 
 		 556 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  38.69 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  39.66 
 
 		 564 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  42.81 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  41.17 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  40.51 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  40.24 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  39.03 
 
 		 555 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  39.03 
 
 		 555 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  40.07 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  37.38 
 
 		 995 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  40.85 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  40.4 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  40.3 
 
 		 554 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  41.39 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  39.12 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  39.12 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  39.12 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  38.87 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3720  formate--tetrahydrofolate ligase  38 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000981333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  39.12 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  41.21 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  38.95 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  38.95 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  38.95 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  39.07 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  38.95 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  38.78 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  38.78 
 
 		 583 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  41.64 
 
 		 557 aa  364  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  38.21 
 
 		 555 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  38.54 
 
 		 542 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  38.55 
 
 		 558 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  38.54 
 
 		 542 aa  362  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  40.35 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  40.35 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  38.42 
 
 		 557 aa  360  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  40.18 
 
 		 557 aa  360  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  40.73 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  37.65 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  38.66 
 
 		 552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  37.31 
 
 		 551 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  36.68 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  37.93 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3146  formate--tetrahydrofolate ligase  39.66 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  37.18 
 
 		 555 aa  353  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  37.3 
 
 		 555 aa  352  7e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  38.93 
 
 		 557 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>