141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0219 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  64.88 
 
 		 567 aa  723    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  60.14 
 
 		 576 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  60.14 
 
 		 576 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  60.03 
 
 		 573 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  60.6 
 
 		 572 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  61.5 
 
 		 567 aa  683    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 		 564 aa  1137    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  61.88 
 
 		 565 aa  666    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  89.01 
 
 		 564 aa  1008    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  59.75 
 
 		 570 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  61.68 
 
 		 566 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  58.11 
 
 		 567 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  59.54 
 
 		 564 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  56.94 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  57.65 
 
 		 554 aa  609  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  55.6 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  53.72 
 
 		 555 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  53.37 
 
 		 556 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  53.19 
 
 		 556 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  56.66 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  56.66 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  55.04 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  53.9 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  55.22 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  55.58 
 
 		 554 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  54.87 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.79 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  54.21 
 
 		 561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  52.93 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  52.85 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.8 
 
 		 553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  54.43 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.26 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  52.13 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  51.04 
 
 		 1021 aa  566  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.79 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.53 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  50.18 
 
 		 556 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0561  formate--tetrahydrofolate ligase  52.17 
 
 		 570 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3469  formate--tetrahydrofolate ligase  52.51 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  51.82 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  51.42 
 
 		 583 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  53.89 
 
 		 558 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  54.42 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  51.47 
 
 		 570 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  54.16 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  53.82 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.73 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  55.73 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  55.73 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  53.9 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  53.29 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 556 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  53.27 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_609  formate--tetrahydrofolate ligase  51.12 
 
 		 597 aa  551  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0932168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  53.38 
 
 		 559 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  46.58 
 
 		 946 aa  551  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 583 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  51.68 
 
 		 556 aa  553  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0671  formate--tetrahydrofolate ligase  50.95 
 
 		 597 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0705  formate--tetrahydrofolate ligase  50.95 
 
 		 597 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 583 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 562 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  54.08 
 
 		 556 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  50.09 
 
 		 555 aa  549  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0520  formate--tetrahydrofolate ligase  51.79 
 
 		 585 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238501  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  50.51 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  52.4 
 
 		 556 aa  549  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  50.86 
 
 		 564 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0640  formate--tetrahydrofolate ligase  50.6 
 
 		 605 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  52.85 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3804  formate--tetrahydrofolate ligase  51.62 
 
 		 585 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.038767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  55.52 
 
 		 565 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  53.9 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  49.06 
 
 		 662 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  54.96 
 
 		 557 aa  545  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  50.51 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3930  formate--tetrahydrofolate ligase  51.45 
 
 		 585 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  48.47 
 
 		 1031 aa  538  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.34 
 
 		 551 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  53.46 
 
 		 555 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  56.06 
 
 		 559 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3314  formate--tetrahydrofolate ligase  50.26 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000257814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  51.48 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  50.35 
 
 		 552 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3748  formate--tetrahydrofolate ligase  51.38 
 
 		 580 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  52.85 
 
 		 559 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.87 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1237  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  52.4 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474316  hitchhiker  0.00654848 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  50.18 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  52.82 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  51.55 
 
 		 582 aa  535  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>