141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28303 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  58.53 
 
 		 1031 aa  724    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  57.49 
 
 		 1021 aa  716    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  57.54 
 
 		 946 aa  720    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  52.75 
 
 		 995 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  100 
 
 		 662 aa  1362    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  57.57 
 
 		 666 aa  685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.14 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  49.06 
 
 		 564 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  49.04 
 
 		 564 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  46.94 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.15 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  45.89 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  45.35 
 
 		 566 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.31 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.5 
 
 		 557 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  44.5 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  44.75 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.09 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.5 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0671  formate--tetrahydrofolate ligase  43.49 
 
 		 597 aa  475  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0705  formate--tetrahydrofolate ligase  43.49 
 
 		 597 aa  475  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_609  formate--tetrahydrofolate ligase  43.49 
 
 		 597 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0932168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3146  formate--tetrahydrofolate ligase  44.98 
 
 		 560 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  43.55 
 
 		 564 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3720  formate--tetrahydrofolate ligase  43.08 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000981333  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  44.65 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0640  formate--tetrahydrofolate ligase  42.7 
 
 		 605 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.79 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  44.18 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.65 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0612  formate--tetrahydrofolate ligase  43.89 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  44.25 
 
 		 555 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  44.34 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  43.57 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  44.18 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  44.5 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  45.23 
 
 		 564 aa  472  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  44.43 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  44.43 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  43.62 
 
 		 556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  43.31 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  44.57 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  43.95 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  42.36 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  42.52 
 
 		 570 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  43.4 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.13 
 
 		 555 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  43.78 
 
 		 555 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  43.24 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  44.43 
 
 		 558 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0561  formate--tetrahydrofolate ligase  43.17 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  42.97 
 
 		 582 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  44.25 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  43.62 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3469  formate--tetrahydrofolate ligase  42.99 
 
 		 569 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  43.81 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  41.73 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  42.68 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  42.23 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0520  formate--tetrahydrofolate ligase  43.23 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3314  formate--tetrahydrofolate ligase  42.66 
 
 		 570 aa  459  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000257814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3804  formate--tetrahydrofolate ligase  42.92 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.038767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  42.99 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3748  formate--tetrahydrofolate ligase  43.26 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  43.64 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  43.4 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  42.3 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  43.11 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  44.75 
 
 		 557 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0451  Formate--tetrahydrofolate ligase  41.44 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  42.19 
 
 		 582 aa  452  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3930  formate--tetrahydrofolate ligase  42.92 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  43.46 
 
 		 556 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  42.68 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  41.42 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  41.67 
 
 		 555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  43.65 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  43.65 
 
 		 557 aa  445  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  43.74 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  42.54 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  42.75 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  42.1 
 
 		 582 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0131  formate--tetrahydrofolate ligase  41.82 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  42.9 
 
 		 583 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  42.59 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  42.47 
 
 		 558 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  42.28 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  42.32 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2687  formate--tetrahydrofolate ligase  43.26 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162948  hitchhiker  0.00130588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  44.76 
 
 		 559 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  41.26 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  41.26 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  42.59 
 
 		 562 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  42.3 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>