141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3146 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  66.32 
 
 		 570 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0561  formate--tetrahydrofolate ligase  66.49 
 
 		 570 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3469  formate--tetrahydrofolate ligase  66.61 
 
 		 569 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  66.67 
 
 		 570 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3146  formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 		 560 aa  1134    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0520  formate--tetrahydrofolate ligase  64.96 
 
 		 585 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  67.5 
 
 		 564 aa  760    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3314  formate--tetrahydrofolate ligase  65.79 
 
 		 570 aa  730    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000257814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3804  formate--tetrahydrofolate ligase  65.3 
 
 		 585 aa  728    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.038767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0612  formate--tetrahydrofolate ligase  65.38 
 
 		 570 aa  747    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3720  formate--tetrahydrofolate ligase  65.73 
 
 		 570 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000981333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3930  formate--tetrahydrofolate ligase  65.13 
 
 		 585 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  66.43 
 
 		 570 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3748  formate--tetrahydrofolate ligase  65.34 
 
 		 580 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  53.18 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  53.69 
 
 		 582 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  54.72 
 
 		 582 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2184  formate--tetrahydrofolate ligase  50.6 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  50.43 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.83 
 
 		 567 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  48.7 
 
 		 567 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  49.39 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  49.74 
 
 		 557 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  46.96 
 
 		 1021 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.52 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  48.89 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  47.17 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  46.85 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  47.19 
 
 		 556 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.74 
 
 		 565 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  47.17 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  45.98 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  45.3 
 
 		 662 aa  478  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  46.92 
 
 		 555 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  47.74 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  46.84 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  48.43 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  48.43 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.69 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  47.18 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  47.54 
 
 		 560 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  47.46 
 
 		 558 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.17 
 
 		 557 aa  468  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  45.45 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  46.57 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.01 
 
 		 554 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  44.76 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  46.98 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.96 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  42.61 
 
 		 946 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  47.45 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  46.95 
 
 		 557 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  46.54 
 
 		 566 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.6 
 
 		 557 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0769  formate-tetrahydrofolate ligase  45.58 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  44.93 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  44.11 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  44.93 
 
 		 556 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  47.29 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.93 
 
 		 572 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  43.45 
 
 		 1031 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  44.04 
 
 		 555 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  46.6 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  43.74 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.47 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  45.62 
 
 		 542 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  43.52 
 
 		 569 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  46.84 
 
 		 559 aa  452  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.68 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  46.42 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  45.1 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1055  formate--tetrahydrofolate ligase  43.98 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  41.63 
 
 		 995 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  46.41 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  46.75 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  45.44 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  44.21 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0451  Formate--tetrahydrofolate ligase  43.08 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  46 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  46.26 
 
 		 573 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  40.92 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  42.63 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  42.73 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  47.54 
 
 		 559 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  42.86 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  42.73 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  42.73 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  46 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2901  formate--tetrahydrofolate ligase  46.97 
 
 		 565 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  42.73 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  43.71 
 
 		 666 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  41.61 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  46.49 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  42.56 
 
 		 562 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  42.56 
 
 		 562 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  43.23 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0131  formate--tetrahydrofolate ligase  43.16 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  42.38 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  45.45 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  42.38 
 
 		 562 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>