62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2202 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1274    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  39.46 
 
 		 487 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  38.05 
 
 		 439 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  35.23 
 
 		 431 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  36.82 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  34.82 
 
 		 462 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  36.65 
 
 		 432 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  38.05 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  33.72 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  34.25 
 
 		 464 aa  123  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  33.79 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  34.7 
 
 		 464 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  24.08 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.46 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.6 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1931  deacylase-like protein  33.33 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.36 
 
 		 335 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  30.37 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  25.57 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.28 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.58 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.89 
 
 		 355 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.81 
 
 		 265 aa  50.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  27.97 
 
 		 333 aa  50.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 343 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.17 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.69 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.51 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.61 
 
 		 340 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.13 
 
 		 326 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.28 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.25 
 
 		 336 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.41 
 
 		 337 aa  48.5  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  28.93 
 
 		 345 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.73 
 
 		 354 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0590  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.93 
 
 		 341 aa  47.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.79 
 
 		 337 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 		 267 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.66 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  28.81 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 337 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.31 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 337 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.98 
 
 		 314 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.21 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.7 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.67 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.12 
 
 		 337 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  32 
 
 		 332 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  33 
 
 		 342 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.89 
 
 		 334 aa  43.9  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>