27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1692 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  100 
 
 
435 aa  892    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  48.9 
 
 
431 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  42.13 
 
 
437 aa  343  4e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  44.55 
 
 
432 aa  342  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  38.71 
 
 
487 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  36.07 
 
 
512 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  40.14 
 
 
439 aa  310  5e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  36.5 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  39.72 
 
 
462 aa  299  6e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  38.33 
 
 
464 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  38.52 
 
 
464 aa  289  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  34.25 
 
 
497 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  38.57 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  36.82 
 
 
617 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  27.5 
 
 
293 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  22.22 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.64 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  26.98 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.7 
 
 
400 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.69 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0137  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.71 
 
 
376 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1738  hypothetical protein  24.88 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.68 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.09 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  33.67 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.14 
 
 
615 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  31.63 
 
 
335 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>