25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1878 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  100 
 
 
497 aa  1023    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  55.78 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  53.63 
 
 
462 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  49.46 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  43.47 
 
 
439 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  41.63 
 
 
437 aa  365  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  43.6 
 
 
464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  43.6 
 
 
464 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  40.48 
 
 
432 aa  352  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  42.36 
 
 
462 aa  349  8e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  42.86 
 
 
464 aa  346  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  32.72 
 
 
435 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  37.38 
 
 
431 aa  290  4e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  37.04 
 
 
617 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  28.75 
 
 
293 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  31.82 
 
 
293 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.99 
 
 
400 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  25.16 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.46 
 
 
406 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0590  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.64 
 
 
299 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1738  hypothetical protein  21.4 
 
 
404 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.14 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1931  deacylase-like protein  32.67 
 
 
271 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  33.33 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 
346 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>