42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2599 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
267 aa  523  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.75 
 
 
267 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.99 
 
 
265 aa  278  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  56.18 
 
 
264 aa  277  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.13 
 
 
272 aa  234  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2008  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.19 
 
 
294 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.49832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  35.88 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.53 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  26.75 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2306  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.67 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  0.0574212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.81 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.67 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  33.78 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.71 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.85 
 
 
481 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.58 
 
 
326 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 
617 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1016  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.24 
 
 
339 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.9 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  41.33 
 
 
322 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.49 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  40.54 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  40 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  40.54 
 
 
322 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.71 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  38.67 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  30.39 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.56 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.02 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2287  hypothetical protein  28.7 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.31 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0559  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.83 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.21 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  36.46 
 
 
371 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  31.88 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  27.38 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  29.41 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  41.27 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  27.72 
 
 
289 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  27.72 
 
 
289 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>