38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3449 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 324 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  83.64 
 
 		 324 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  75 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  72.33 
 
 		 325 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  69.94 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  74.68 
 
 		 325 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  67.49 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  68.73 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  67.8 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  67.49 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  67.8 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  67.49 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  67.49 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  67.49 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  59.2 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  58.59 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  60.13 
 
 		 327 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.59 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  50.79 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  50.79 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.54 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.09 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  49.84 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.8 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.38 
 
 		 348 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.05 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.76 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.41 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.77 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.42 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.04 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.57 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.96 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  32.8 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.4 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.47 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  20.2 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>