37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3619 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 311 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.13 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.55 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.88 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.88 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.48 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.48 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.93 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.48 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.48 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  39.48 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  39.16 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  39.48 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.04 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.05 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.4 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  36.57 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  36.57 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.86 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  37.71 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.91 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.01 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  35.87 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.82 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.72 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.91 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  27.64 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.95 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.65 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.32 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  32.2 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  32.2 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.29 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  31.82 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>