58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0681 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 326 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  62.58 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  56.56 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  59.87 
 
 		 322 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.69 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  25.4 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.25 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  26.86 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.37 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.19 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.38 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.04 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  27.31 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  27.31 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.51 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  24.61 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  24.61 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  24.61 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  24.61 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  24.61 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.15 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  24.61 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  24.61 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.23 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.6 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.66 
 
 		 406 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.41 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.41 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2008  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.31 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.49832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.41 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  29.13 
 
 		 617 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.68 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  25.19 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  31.48 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.48 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.17 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.58 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.48 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.48 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.48 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.48 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  22.98 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.11 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  32.67 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.48 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.94 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  30.69 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  22.8 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  29.1 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  32.46 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.08 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.7 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.24 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.83 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  29.7 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>