51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0821 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
325 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  75.16 
 
 
324 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  75.16 
 
 
324 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  72.41 
 
 
330 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  72.31 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.68 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  50.46 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.54 
 
 
324 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.94 
 
 
408 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.94 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.94 
 
 
338 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.94 
 
 
338 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.94 
 
 
338 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  50.63 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  50.31 
 
 
407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  50.63 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.72 
 
 
328 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.04 
 
 
328 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.96 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  47.84 
 
 
325 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.71 
 
 
328 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.81 
 
 
327 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.57 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.99 
 
 
319 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.92 
 
 
348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.72 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.13 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
349 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.04 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  35.83 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.94 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  27.94 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2918  succinylglutamate desuccinylase  26.58 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.354505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  30 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0681  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.08 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.281437  normal  0.0202656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.11 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1563  succinylglutamate desuccinylase  26.4 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.87 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.34 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.46 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.67 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.04 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  33.68 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.5 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.95 
 
 
426 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.36 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  30.36 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.99 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  28.3 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  23.37 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>