39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1016 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1016  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
339 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0195  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  64.55 
 
 
335 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.00000014787  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2287  hypothetical protein  49.12 
 
 
340 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0559  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.46 
 
 
340 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2306  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.48 
 
 
337 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  0.0574212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2113  hypothetical protein  36.86 
 
 
353 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842799  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1912  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.79 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1833  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.9 
 
 
347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1229  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.81 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1224  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.05 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5063  hypothetical protein  33.74 
 
 
347 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1741  hypothetical protein  23.51 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.09 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.2 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2275  hypothetical protein  28.72 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  31.94 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.75 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.4 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.12 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.19 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.9 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.35 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.24 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.09 
 
 
336 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  27.12 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.75 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.06 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.55 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.52 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  30.39 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  29.9 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.88 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  25.43 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.54 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  24.7 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.07 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.29 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  25.43 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>