22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2306 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2306  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 337 aa  682    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  0.0574212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0195  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.85 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.00000014787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0559  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.05 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2287  hypothetical protein  49.55 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1016  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.48 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1912  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.24 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2113  hypothetical protein  37.95 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842799  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1224  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.36 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1833  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.46 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1229  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.16 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5063  hypothetical protein  32.45 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1741  hypothetical protein  25.9 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2275  hypothetical protein  24.85 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175878  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.37 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.67 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.81 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.17 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.53 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  26.21 
 
 		 510 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2008  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.4 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.49832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>