14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2287 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  702    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0559  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.73 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1016  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.12 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0195  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.06 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.00000014787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2306  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.55 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  0.0574212 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1912  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.62 
 
 		 342 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2113  hypothetical protein  40.18 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842799  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1833  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.46 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1229  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.9 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1224  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.23 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5063  hypothetical protein  31.71 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2275  hypothetical protein  22.71 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1741  hypothetical protein  24.29 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.7 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>