23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0214 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  887    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  56.26 
 
 
437 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  54.72 
 
 
432 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  50.22 
 
 
464 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  50.22 
 
 
464 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  50.22 
 
 
464 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  49.13 
 
 
462 aa  435  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  45.97 
 
 
512 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  46.08 
 
 
462 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  44.33 
 
 
487 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  43.44 
 
 
497 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  42.21 
 
 
431 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  40.14 
 
 
435 aa  310  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  38.05 
 
 
617 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.63 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  28.47 
 
 
314 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.73 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1931  deacylase-like protein  29.63 
 
 
271 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0590  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.37 
 
 
299 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  29.81 
 
 
293 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  30.39 
 
 
293 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1738  hypothetical protein  26.98 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0137  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.3 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>