25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2266 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  100 
 
 
512 aa  1053    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  61.8 
 
 
462 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  55.9 
 
 
497 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  48.29 
 
 
487 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  45.97 
 
 
439 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  45.43 
 
 
432 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  43.55 
 
 
437 aa  382  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  42.96 
 
 
464 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  42.47 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  41.83 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  41.98 
 
 
464 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  36.6 
 
 
435 aa  316  7e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  37.23 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  29.83 
 
 
617 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  31.03 
 
 
293 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  30.17 
 
 
293 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1931  deacylase-like protein  33.04 
 
 
271 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  25 
 
 
314 aa  57.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0590  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.64 
 
 
299 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.19 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.41 
 
 
338 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.11 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.11 
 
 
346 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  32.35 
 
 
342 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>