135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3073 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3073  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  44.66 
 
 
263 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  38.58 
 
 
263 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1858  putative ABC transport system permease protein  40.31 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0986378  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  39.63 
 
 
263 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  40.42 
 
 
270 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  37.45 
 
 
256 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  38.67 
 
 
270 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  37.4 
 
 
271 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  37.89 
 
 
263 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  36.07 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  38.03 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  36.13 
 
 
266 aa  118  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  34.62 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  32.03 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  34.21 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  31.33 
 
 
263 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  34.04 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  33.19 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  31.28 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  31.76 
 
 
261 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  35.06 
 
 
265 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  34.27 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  34.96 
 
 
267 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  32.62 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  34.62 
 
 
263 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  28.4 
 
 
251 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  39.2 
 
 
264 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  31.47 
 
 
264 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  36.59 
 
 
267 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  32.31 
 
 
264 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  34.16 
 
 
262 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  34.16 
 
 
262 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  34.31 
 
 
268 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  37.38 
 
 
263 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  33.62 
 
 
269 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  31.33 
 
 
242 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
268 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  31.72 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  44.14 
 
 
261 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  31.3 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  31.3 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  30.25 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  33.19 
 
 
265 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4093  hypothetical protein  33.47 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  30.87 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  30.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  30.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  26.94 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  32.08 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  30.23 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.08 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  31.12 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  34.53 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  30.84 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  31.65 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  34.53 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  33.18 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  28.35 
 
 
257 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  28.89 
 
 
233 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  28.02 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  27.6 
 
 
234 aa  92  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  28.02 
 
 
259 aa  92  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  31.31 
 
 
267 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  32.56 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  25.97 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  30.38 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>