135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0169 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
263 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  39.85 
 
 
265 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1858  putative ABC transport system permease protein  42.21 
 
 
264 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0986378  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  41.57 
 
 
263 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  40.86 
 
 
270 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  39.62 
 
 
263 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  38.17 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  39.62 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  42.54 
 
 
256 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  38.49 
 
 
263 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3073  hypothetical protein  44.66 
 
 
264 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  44.25 
 
 
270 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  38.22 
 
 
266 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  43.36 
 
 
265 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  42.25 
 
 
267 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  34.5 
 
 
262 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  34.5 
 
 
262 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  36.07 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  39.01 
 
 
267 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  38.97 
 
 
263 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  40.27 
 
 
265 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  36.29 
 
 
258 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  33.04 
 
 
264 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  39.83 
 
 
265 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  36.95 
 
 
257 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  39.91 
 
 
261 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  36 
 
 
263 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  38.36 
 
 
266 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  37.44 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  39.49 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  38.84 
 
 
262 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  39.01 
 
 
267 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  37.81 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  39.3 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  38.01 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  37.76 
 
 
261 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  38.33 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  38.33 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  39.21 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  38.33 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  37.1 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  36.44 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  36.48 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  31.98 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  37.45 
 
 
268 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  38.6 
 
 
272 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  34.39 
 
 
260 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  36.32 
 
 
269 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  35.81 
 
 
269 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  33.02 
 
 
261 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  41.35 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  33.95 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  32.64 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  33.9 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  35.43 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  36 
 
 
263 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  36 
 
 
263 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  30.24 
 
 
261 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  38.89 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  31.6 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  32.3 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  29.63 
 
 
258 aa  118  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  31.58 
 
 
234 aa  118  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  37.98 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  35.27 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  31.64 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  38.1 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  31.64 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  31.64 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  31.64 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  31.64 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  35.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  32.27 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  31.98 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  29.39 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  29.39 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>