135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0764 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  95.17 
 
 		 269 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  91.83 
 
 		 272 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  69.77 
 
 		 268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  68.4 
 
 		 268 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  68.03 
 
 		 268 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  68.18 
 
 		 272 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  69.73 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  68.97 
 
 		 267 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  68.2 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  68.2 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  68.2 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  67.43 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  67.82 
 
 		 267 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  67.43 
 
 		 267 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  56.37 
 
 		 266 aa  242  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  47.97 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  45.49 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  41.63 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  42.8 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  50.22 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  42.7 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  41.76 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  43.51 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  43.24 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  42.47 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  41.11 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  44.8 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  42.47 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  44.26 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  43.3 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  40.47 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  33.2 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  41.9 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  40.16 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  39.34 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  39.52 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  41.81 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  41.81 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  36.43 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  40.89 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  39.52 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  41.91 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  38.36 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  33.72 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  38.79 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  36.59 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  41.26 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  37.2 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  40.83 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  36.8 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  36.33 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  33.07 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  34.96 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  37 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  31.4 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  34.5 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  38.03 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  34.5 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.39 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  30.42 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  35.56 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  30.42 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  30.42 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  30.42 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  30.42 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  32.91 
 
 		 258 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.39 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  35.45 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  28.3 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.92 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  37.92 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>