146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5259 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5259  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1198  DNA repair protein RecO  72.2 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.456888  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2618  DNA repair protein RecO  70.11 
 
 		 262 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3265  DNA repair protein RecO  70.11 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2343  DNA repair protein RecO  71.48 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.89674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3059  DNA repair protein RecO  60.24 
 
 		 249 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  59.45 
 
 		 249 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1751  DNA repair protein RecO  61.02 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00839209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1404  DNA repair protein RecO  62.98 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  51.57 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0596  DNA repair protein RecO  45.12 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  43.97 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  43.19 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  42.02 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  41.96 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  41.7 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  43.58 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  42.8 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  42.8 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  43.19 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  43.19 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  43.19 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  41.04 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  41.31 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  40.86 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  41.25 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  38.98 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  39.45 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  39.06 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  37.25 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  38.34 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  40.23 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  40.23 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  37.83 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  35.56 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  35.56 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  35.56 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  35.56 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  35.56 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  35.98 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  36.4 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  35.51 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  45.45 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  34.74 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  36.36 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  36.33 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  34.31 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  35.5 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  33.05 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  33.05 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  33.05 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  31.6 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  35.75 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  34.44 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  34.02 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  31.89 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  41.96 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  39.16 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  33.88 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  40.56 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4372  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4286  DNA repair protein RecO  33.88 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  36.42 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  32.08 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1386  DNA repair protein RecO  37.36 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  32.38 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  32.92 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  31.6 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1075  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  36.76 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  30.24 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3024  DNA repair protein RecO  32.78 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1350  DNA repair protein RecO  32.78 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2928  DNA repair protein RecO  32.78 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1161  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  34.19 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2846  DNA repair protein RecO  32.78 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.403823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  32.08 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  30.2 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  30.2 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  35.59 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2927  DNA repair protein RecO  31.23 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  31.67 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>