29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0938 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0938  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  310  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2419  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  63.37 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1851  transcriptional regulator, XRE family  50.66 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0351  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.19 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.598178  normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  51.16 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.26 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  32.18 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2712  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  30 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  48.89 
 
 		 509 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1480  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 508 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1798  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.853866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1808  XRE family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0459623  normal  0.163421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  31.86 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 112 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4943  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 82 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.505342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>