34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1099 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  961    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  35.18 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  31.29 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  31.98 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  31.18 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5403  hypothetical protein  28.54 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0921  hypothetical protein  26.9 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.682885  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2312  hypothetical protein  23.36 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.414585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  25.58 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  26.3 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3094  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  27.58 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  26.71 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  24.61 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  22.47 
 
 		 529 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  22.33 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  22.15 
 
 		 561 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  25 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  22.15 
 
 		 553 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  22.26 
 
 		 491 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  24.14 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  24.77 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  23.02 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  26.18 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  23.96 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  25.66 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  22.78 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  22.12 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  22.54 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  22.12 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  22.12 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  22.46 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  23.77 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>