27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03863 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  814    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  44.77 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  39.76 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  39.47 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  38.88 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  37.47 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  39.35 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  38.7 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  38.24 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  37.84 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  36.93 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  37.13 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  37.16 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  37.87 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  33.82 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  34.5 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  33.07 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  28.34 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 482 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  25.53 
 
 		 329 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  27.45 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  26.79 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  25.66 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  21.93 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>