19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2382 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  906    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  53.26 
 
 
450 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5403  hypothetical protein  38.74 
 
 
519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  30.72 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  31.67 
 
 
457 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  31.78 
 
 
464 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2312  hypothetical protein  24.29 
 
 
435 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.414585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0921  hypothetical protein  27.34 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.682885  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3094  hypothetical protein  22.16 
 
 
238 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  24.31 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3095  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  27.81 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  22.96 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  22.72 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  25.77 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  35.05 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  26.75 
 
 
408 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  23.09 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  23.57 
 
 
564 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>